More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3697 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  65.91 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  63.96 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  63.31 
 
 
309 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  63.64 
 
 
312 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  66.99 
 
 
313 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  60.45 
 
 
311 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  61.41 
 
 
313 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  61.94 
 
 
308 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  60.26 
 
 
316 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  62.06 
 
 
311 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.71 
 
 
311 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  62.87 
 
 
305 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  59.74 
 
 
309 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.28 
 
 
306 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  60.26 
 
 
307 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  60.91 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  58.06 
 
 
308 aa  351  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  61.17 
 
 
310 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  53.9 
 
 
306 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  58.99 
 
 
321 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  60.13 
 
 
311 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  52.87 
 
 
316 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  49.19 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  52.55 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  49.19 
 
 
316 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  52.87 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  52.9 
 
 
309 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  38.06 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  39.17 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  39.41 
 
 
305 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  33.44 
 
 
310 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.45 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  33.55 
 
 
313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  33.55 
 
 
313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  36.44 
 
 
285 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  36.44 
 
 
285 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  36.03 
 
 
285 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.9 
 
 
313 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 
281 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
322 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  35.06 
 
 
286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  30.77 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  35.22 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  29.54 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  31.06 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 
290 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  35.44 
 
 
300 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  35.44 
 
 
300 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.6 
 
 
292 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  38.24 
 
 
298 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  32.48 
 
 
290 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  35.65 
 
 
307 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  32.79 
 
 
288 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  31.85 
 
 
338 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.23 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.23 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  30.66 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.23 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  31.83 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.91 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  32.82 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  28.04 
 
 
335 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  36.64 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  34.76 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  27.61 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
343 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  34.14 
 
 
484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.58 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  32.01 
 
 
327 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  30.43 
 
 
338 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 
323 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  30.43 
 
 
338 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  33.19 
 
 
288 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  27.88 
 
 
330 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.24 
 
 
287 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.39 
 
 
328 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  27.12 
 
 
330 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 
293 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  30.43 
 
 
338 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  33.59 
 
 
310 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  26.07 
 
 
326 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  30.98 
 
 
325 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  35.9 
 
 
350 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
330 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  27.57 
 
 
342 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  30.3 
 
 
256 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 
314 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
328 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
339 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  29.3 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>