More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  60.2 
 
 
300 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  60.2 
 
 
300 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  61.96 
 
 
300 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  58.86 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  52.41 
 
 
290 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  53.66 
 
 
288 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  52.99 
 
 
294 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  50.17 
 
 
290 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  58.47 
 
 
288 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  56.12 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.98 
 
 
287 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  51.04 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  48.21 
 
 
293 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  39.69 
 
 
281 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  42.56 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  42.92 
 
 
309 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  42.92 
 
 
309 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  42.92 
 
 
309 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  36.7 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  48.13 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  42.36 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  42.98 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  39.57 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
343 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  41.48 
 
 
323 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  39.48 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  39.14 
 
 
484 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  38.91 
 
 
332 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  42.05 
 
 
287 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  37.07 
 
 
309 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  39.5 
 
 
330 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.29 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.29 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  36.86 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 
316 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.66 
 
 
328 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  40.83 
 
 
332 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  40.58 
 
 
305 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  37.99 
 
 
335 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  41.45 
 
 
328 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
309 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 
342 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  35.53 
 
 
316 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  39.06 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  35.53 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  36.82 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  36.82 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  36.82 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  40.89 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  39.62 
 
 
290 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  33.7 
 
 
319 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  36.82 
 
 
330 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  32.14 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  34.01 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  40.28 
 
 
310 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  36.32 
 
 
330 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  37.98 
 
 
311 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  33.78 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  35.69 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  37.67 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  35.69 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.5 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  37.56 
 
 
308 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  35.69 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  37.56 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  38.53 
 
 
313 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  38.07 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  38.07 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  34.87 
 
 
310 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 
307 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  39.35 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  37.43 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.21 
 
 
311 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  38.14 
 
 
311 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  38.79 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  36.02 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.32 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  38.5 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
308 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 
307 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.3 
 
 
306 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.86 
 
 
262 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
311 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  34.73 
 
 
347 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.92 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.04 
 
 
255 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  30.92 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.8 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.82 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  31.42 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>