More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2683 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  57.82 
 
 		 300 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  57.82 
 
 		 300 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  58.16 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.52 
 
 		 292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  56.98 
 
 		 290 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  57.89 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  54.72 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  52.72 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  55.47 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  56.22 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  56.41 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  49.07 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  52.74 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  42.98 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  45.33 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  41.6 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  41.28 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  41.28 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  41.28 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  42.72 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  40.64 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  38.81 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  40.98 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  44.39 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  46.53 
 
 		 257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  39.83 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  40.51 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  40.15 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  43.46 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  41.03 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  39.5 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  41.12 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  46.4 
 
 		 484 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  41.12 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  36.93 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  39.65 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  40.64 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  39.81 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 327 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  40.84 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  40.84 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  40.84 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  38.66 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.42 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  40.45 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  35.69 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  36.92 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  41.67 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  36.92 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  36.92 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.85 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  38.21 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  40.51 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  40.3 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  38.86 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  38.64 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  40.22 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  34.83 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  42.65 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  41.67 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  38.1 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  39.82 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  38.91 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  38.91 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  38.91 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  41.15 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  38.26 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  38.97 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  38.26 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  39.25 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  41.92 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  36.82 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  37.45 
 
 		 353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  37.56 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  37.33 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  38.18 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.81 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.33 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  39.8 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  34.63 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  36.95 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.4 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  39.59 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.34 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.38 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  41.9 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  33.93 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>