More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0961 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.44 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  49.48 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  44.36 
 
 
296 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  42.24 
 
 
295 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  42.21 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  47.09 
 
 
297 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  39.05 
 
 
283 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  41.54 
 
 
302 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  43.75 
 
 
293 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  44 
 
 
296 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  44.02 
 
 
293 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  37.09 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  39.56 
 
 
306 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  36.17 
 
 
287 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  35.44 
 
 
285 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  35.44 
 
 
285 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  35.02 
 
 
285 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  34.87 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  37.33 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  35.08 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  34.08 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  42.11 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 
281 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  35 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.26 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.56 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  36.16 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  32.4 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  32.4 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.81 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  36.55 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.4 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  40.54 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  36.78 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  35.86 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  35.86 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  35.86 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  35.86 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  29.61 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  35.17 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.11 
 
 
328 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  36.97 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  37.43 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  36.97 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  32.93 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  36.97 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  34.73 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.31 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  37.35 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  40.58 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  33.19 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  36.31 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.02 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  40.65 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.12 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  30.33 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  35.63 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30.33 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  32.37 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.78 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  30.59 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  34.76 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  33.33 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4216  luciferase family protein  33.99 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862058  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.17 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  35.35 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  33.33 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  33.33 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  33.79 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.91 
 
 
753 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  34.48 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  35.56 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.51 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.78 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  33.51 
 
 
327 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  34.71 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
557 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  35.04 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.23 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  33.71 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
754 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.07 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>