More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4906 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  100 
 
 
325 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  50.53 
 
 
291 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  40.33 
 
 
310 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  39.02 
 
 
310 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  38.94 
 
 
313 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  38.61 
 
 
313 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  38.61 
 
 
313 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 
322 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  35.27 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.31 
 
 
343 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  28.87 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  32.28 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  40.35 
 
 
281 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  32.34 
 
 
313 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  34.25 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.2 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  38.82 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  29.94 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  34.12 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
311 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  34.24 
 
 
316 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.36 
 
 
309 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  37.02 
 
 
309 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.36 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  37.02 
 
 
309 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  37.02 
 
 
309 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 
317 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 
308 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  30.84 
 
 
310 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.36 
 
 
309 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.78 
 
 
310 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  42.42 
 
 
310 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
308 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  31.95 
 
 
309 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
290 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  32.3 
 
 
320 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  30.74 
 
 
316 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.9 
 
 
306 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  40.51 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  28.62 
 
 
330 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  31.56 
 
 
316 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  35.36 
 
 
309 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.2 
 
 
306 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
327 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.61 
 
 
286 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  32.08 
 
 
347 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.91 
 
 
328 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  37.57 
 
 
307 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
314 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  26.53 
 
 
330 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 
306 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  31.1 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  36.46 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  30.43 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  30.03 
 
 
321 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.52 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.51 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.46 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.22 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.2 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35.32 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.97 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.97 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  37.97 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  33.73 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  35.98 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  29.64 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.13 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  38.25 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  38.86 
 
 
310 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  37.21 
 
 
327 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  36.14 
 
 
283 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  26.05 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  35 
 
 
256 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  39.11 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  25.83 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  36.42 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.54 
 
 
330 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  35.91 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  28.39 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
321 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  34.29 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.68 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  26.07 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  32.01 
 
 
543 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  26.07 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  26.07 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  34.44 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  26.69 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  26.58 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>