More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0625 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
332 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.82 
 
 
328 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  66.46 
 
 
328 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  63.22 
 
 
328 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  62.5 
 
 
330 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  61.09 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  61.52 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  61.52 
 
 
338 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  61.52 
 
 
338 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  60 
 
 
330 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  59.21 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  59.04 
 
 
330 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  56.2 
 
 
342 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  45.32 
 
 
321 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  43.33 
 
 
335 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  43.07 
 
 
323 aa  275  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  42.09 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  41.69 
 
 
332 aa  268  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
316 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.23 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  34.14 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.3 
 
 
286 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  39.06 
 
 
282 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  39.01 
 
 
287 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  44.55 
 
 
281 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  38.12 
 
 
285 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  31.92 
 
 
285 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  31.92 
 
 
285 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  39.42 
 
 
300 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  39.42 
 
 
300 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  36.11 
 
 
313 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  36.11 
 
 
313 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  36.11 
 
 
313 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
257 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  38.94 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  39.75 
 
 
290 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.04 
 
 
292 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  41.36 
 
 
288 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.41 
 
 
255 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 
328 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
287 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.49 
 
 
262 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  33.45 
 
 
307 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.76 
 
 
287 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  39.9 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  34.05 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  41.03 
 
 
251 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  38.14 
 
 
290 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  34.25 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  36.04 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  36.04 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  36.04 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.88 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  35.17 
 
 
294 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
288 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.75 
 
 
252 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  36.97 
 
 
269 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.67 
 
 
287 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.86 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  38.5 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  39.27 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.03 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.72 
 
 
309 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.72 
 
 
312 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6045  hypothetical protein  39.18 
 
 
265 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0597189  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  40.1 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  31.88 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  37.26 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  38.14 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  38.14 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  38.14 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.18 
 
 
266 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2902  hypothetical protein  38.31 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0865199  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 
293 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10043  oxidoreductase  38.07 
 
 
264 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  30.98 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.5 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.11 
 
 
261 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 
290 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 
307 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  29.63 
 
 
310 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  29.9 
 
 
308 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  28.57 
 
 
319 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 
307 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.85 
 
 
311 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  28.85 
 
 
316 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  28.95 
 
 
313 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.38 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  29.35 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  27.81 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  36.15 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 
296 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  29.3 
 
 
307 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11520  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.87 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>