More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0516 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  100 
 
 		 327 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  60.55 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  58.23 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  40.73 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  36.97 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.27 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.62 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.12 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  33.23 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  33.74 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  31.99 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  34.58 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  34.58 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  34.58 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  33.13 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 		 281 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  31.67 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  31.54 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.14 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  30.85 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.27 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  31.77 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  41.84 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  29.27 
 
 		 307 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.67 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.67 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  29.81 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.67 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  37.57 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  30.1 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  30.87 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  30.77 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  31.97 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.03 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.02 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.21 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  28.82 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  38.04 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  36.41 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  38.31 
 
 		 282 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  35.98 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  30.63 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  31.18 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  31.18 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  33.8 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  32.45 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  31.96 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.26 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.82 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  31.58 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.15 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  29.08 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  32.11 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  32.11 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  28.99 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  32.11 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  30.38 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  39.87 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  35.9 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  35.9 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  31.6 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  40 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  38.89 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.46 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.95 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  32.03 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.44 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.44 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.07 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  37.6 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  37.87 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.01 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>