More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0213 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
336 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  64.17 
 
 
326 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  40.53 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  41.42 
 
 
327 aa  208  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  39.47 
 
 
339 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.41 
 
 
304 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  37.97 
 
 
310 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 
311 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  34.51 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  35.74 
 
 
325 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  33.33 
 
 
350 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  34.06 
 
 
327 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
289 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.21 
 
 
296 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  32.78 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0791  Luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.393824  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  31.06 
 
 
289 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  30.82 
 
 
274 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  42.95 
 
 
286 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  38.38 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  40.56 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  44.06 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  44.06 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  45.77 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  44.06 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  39.23 
 
 
309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  32.29 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  32.29 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  42.25 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  32.29 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  39.66 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.1 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  41.71 
 
 
307 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  35.06 
 
 
311 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  36.19 
 
 
347 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  39.66 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.56 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  36.79 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.86 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  34.83 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  38.2 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  38.2 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  38.2 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 
287 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 
287 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
314 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  33.33 
 
 
330 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  37.56 
 
 
316 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.98 
 
 
310 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  36.32 
 
 
308 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.48 
 
 
352 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  38.86 
 
 
306 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.18 
 
 
328 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  35.26 
 
 
328 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  33.06 
 
 
294 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
332 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  35.23 
 
 
321 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  43.02 
 
 
324 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  36.99 
 
 
328 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 
305 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.82 
 
 
346 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  34.36 
 
 
316 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  32.29 
 
 
284 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  39.23 
 
 
309 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 
288 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
328 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  37.79 
 
 
313 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  33.33 
 
 
338 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  37.79 
 
 
313 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.28 
 
 
306 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  41.38 
 
 
307 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  34.93 
 
 
328 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  29.5 
 
 
362 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.62 
 
 
307 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  33.96 
 
 
309 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  33.96 
 
 
312 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 
323 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  36.16 
 
 
313 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.64 
 
 
296 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  31.43 
 
 
313 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  35.94 
 
 
293 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  31.56 
 
 
316 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  34.66 
 
 
284 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.2 
 
 
307 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 
326 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  39.08 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  36.32 
 
 
283 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  36.32 
 
 
283 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  33.49 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  36.32 
 
 
283 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  40.74 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  36.78 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  41.32 
 
 
287 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  40.11 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>