More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0173 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
326 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  64.17 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  38.39 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  38.08 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  33.82 
 
 
350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  35.31 
 
 
339 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  34.84 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.98 
 
 
304 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  34.02 
 
 
325 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  31.86 
 
 
327 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  34.67 
 
 
310 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
296 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  31.91 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  30.94 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  32.31 
 
 
274 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  30.95 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 
287 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  29.41 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
343 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
316 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0791  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
307 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.393824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
293 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
282 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 
308 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 
311 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
284 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.71 
 
 
310 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
311 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.96 
 
 
299 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  34.91 
 
 
352 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  36.46 
 
 
313 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.55 
 
 
290 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.03 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.18 
 
 
328 aa  99  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.91 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.71 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  37.36 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.71 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.71 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  36.56 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  31.96 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.18 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32.02 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  36.96 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  34.29 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.84 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  33.33 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.59 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.59 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  37.59 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  37.31 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.31 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  37.7 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  38.15 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  37.4 
 
 
308 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.81 
 
 
286 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  37.4 
 
 
308 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  35.42 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  32.4 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  36.02 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.31 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  29.47 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  29.47 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  29.47 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.32 
 
 
278 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  34.48 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.24 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.24 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.96 
 
 
341 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  27.74 
 
 
330 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  36.23 
 
 
281 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  35.26 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  33.49 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  31.44 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.33 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  32.68 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  36.36 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  31.44 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.65 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  29.05 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  31.44 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.05 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  36.57 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0106  luciferase-like  31.82 
 
 
362 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.013703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  28.97 
 
 
311 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  31.25 
 
 
325 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  34.52 
 
 
289 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  28.39 
 
 
364 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  34.43 
 
 
285 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
296 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>