More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3538 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
278 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  44.44 
 
 
307 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  41.75 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  40.83 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.3 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  45.6 
 
 
278 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  40.3 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.09 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  40.89 
 
 
272 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  33.58 
 
 
311 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  37.62 
 
 
337 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.87 
 
 
273 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  43.01 
 
 
283 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.81 
 
 
299 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  43.01 
 
 
283 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  36.31 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  43.01 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36.6 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  36.62 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  36.62 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  38.07 
 
 
306 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  37.63 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  42.7 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  38.76 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  36.62 
 
 
293 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  43.68 
 
 
286 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  38.73 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.86 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  38.73 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  38.73 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  39.9 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  41.18 
 
 
281 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  37.79 
 
 
290 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  38.68 
 
 
289 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  42.35 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  39.2 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  42.08 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.12 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  46.75 
 
 
291 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  46.75 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  46.75 
 
 
351 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  35 
 
 
315 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  45.1 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  38.46 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  42.24 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  37.29 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  41.34 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  40.72 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.57 
 
 
346 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  34.47 
 
 
298 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  39.79 
 
 
291 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  41.71 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.64 
 
 
287 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
343 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  40.72 
 
 
306 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 
285 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.56 
 
 
285 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  45.1 
 
 
295 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 
299 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  37.56 
 
 
335 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  35.66 
 
 
327 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  36.4 
 
 
290 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  39.53 
 
 
339 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  39.52 
 
 
306 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  39.52 
 
 
306 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32 
 
 
339 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  39.52 
 
 
306 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  34.5 
 
 
306 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  35.33 
 
 
264 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  35.33 
 
 
264 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  35.33 
 
 
264 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  36.36 
 
 
353 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  36.11 
 
 
284 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 
322 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.3 
 
 
314 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.46 
 
 
313 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  36.04 
 
 
340 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.07 
 
 
277 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  33.51 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  33.51 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  33.51 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  33.51 
 
 
320 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  33.51 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  33.51 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  34.25 
 
 
309 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  38.24 
 
 
328 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  42.77 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  43.05 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  37.36 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  37.79 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.43 
 
 
364 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  34.57 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.43 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>