More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7093 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  100 
 
 		 340 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  66.86 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  45.43 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  47.48 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  45.11 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  43.99 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  38.68 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  40.81 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  38.2 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  38.82 
 
 		 322 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  36.94 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  37.58 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  38.7 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  36.65 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  39.37 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  38.36 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  35.78 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  36.39 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  36.11 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  36.42 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  36.11 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  36.11 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.42 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  36.11 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  34.21 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  38.18 
 
 		 307 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  33.86 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  35.17 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  36.42 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  32.6 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  36.84 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  36.84 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  36.84 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  35.47 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  36.22 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  35.24 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  34.27 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  34.27 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  34.27 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  33.85 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  35.56 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  32.92 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.83 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.04 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.81 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.21 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.52 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  31.71 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  26.17 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.21 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.63 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  31.03 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.69 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  27.35 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.97 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.69 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.69 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.65 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  30.34 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.4 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.46 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  26.07 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.49 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  29.91 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  29.91 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.3 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.77 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.57 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  28.23 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  30.81 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  24.78 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.9 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.44 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  28.28 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  29.51 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.48 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  25.38 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  25.62 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  37.08 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>