More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4178 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  95.93 
 
 		 344 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 344 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  80.06 
 
 		 346 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  79.3 
 
 		 345 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  64.72 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  68.18 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  64.01 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  63.5 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  60.71 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  59.17 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.01 
 
 		 372 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  54.55 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.16 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.55 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.67 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.17 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.87 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  29.48 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  45 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  30.57 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.82 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.47 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  31.42 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.63 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.76 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.06 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.92 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.72 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  30.61 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.88 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.88 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  42.94 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  33.33 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.69 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 338 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.79 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  47.96 
 
 		 382 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  31.7 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  35.26 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.31 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  46.3 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  29.91 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.99 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.33 
 
 		 6889 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  36.08 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  28.41 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.46 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.88 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.94 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.58 
 
 		 380 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  38.36 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  28.53 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  29.25 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  28.71 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  39.83 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  33.76 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.41 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  29.35 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.73 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  40.85 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  39.67 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  39.67 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  28.57 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  56.25 
 
 		 343 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  44.44 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.95 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  43.14 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  38.41 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  38.41 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.23 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  29.63 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.99 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  42.15 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  37.68 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.16 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  34.1 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  37.6 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  29.43 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>