More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1423 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  96.48 
 
 		 341 aa  681    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  100 
 
 		 341 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  87.06 
 
 		 340 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  84.12 
 
 		 340 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  84.41 
 
 		 340 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  81.76 
 
 		 340 aa  594  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  81.76 
 
 		 340 aa  590  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  83.24 
 
 		 338 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  82.06 
 
 		 340 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  82.94 
 
 		 340 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  81.47 
 
 		 344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  84.12 
 
 		 348 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  79.41 
 
 		 340 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  76.18 
 
 		 344 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  74.71 
 
 		 340 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  71.76 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  72.35 
 
 		 340 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  73.08 
 
 		 338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  72.86 
 
 		 340 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  73.53 
 
 		 338 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  73.53 
 
 		 341 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.71 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  59.82 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  60.06 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  61.11 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  56.47 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.77 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  49.13 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.53 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  48.06 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.57 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.52 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.34 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.41 
 
 		 342 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.86 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  30.56 
 
 		 381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  27.56 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  28.7 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  30.51 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  29.45 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.23 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  26.29 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.06 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.19 
 
 		 127 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.57 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.78 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.74 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.08 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.66 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  27.66 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.62 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.76 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  40.21 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.69 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.95 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.04 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.8 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.95 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.71 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  26.47 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  27.81 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.34 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  25.61 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  35 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  38.1 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  25.72 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.95 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  36.61 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  27.64 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  32.23 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.1 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  42.5 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  28.41 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  37.25 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.04 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.88 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  32 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.04 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  31.25 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  31.25 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  37.65 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  63.16 
 
 		 58 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.6 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  24.12 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.82 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>