More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2108 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  100 
 
 		 380 aa  780    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  61.74 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.58 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  33.52 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.35 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  33.88 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.9 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  37.56 
 
 		 439 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.28 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.28 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.28 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  36.65 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.15 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.13 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  32.75 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.35 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  32.99 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.84 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.43 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.05 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.38 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.2 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  31.3 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  31.1 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.83 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.81 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.43 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  36.46 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  36.46 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  35.82 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  29.96 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.64 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  32.14 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  28.74 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  33.33 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  32.68 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.56 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.32 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.58 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  32.4 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.82 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.27 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.38 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.44 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.41 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.03 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  29.67 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.26 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.26 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  34.68 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.43 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  25.76 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.05 
 
 		 307 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  24.62 
 
 		 347 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.94 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  25.31 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  29.75 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.04 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  25.71 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.68 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  30.53 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  28.77 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  28 
 
 		 3337 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  38.33 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.59 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.98 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  29.21 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.28 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.41 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  30.61 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  34.55 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30.67 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  26.63 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  28.14 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  26.51 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  26.49 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  33.94 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  27.81 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  27.43 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>