250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
365 aa  706    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.95 
 
 
361 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  36.56 
 
 
345 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 
344 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 
340 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  34.42 
 
 
338 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  35.88 
 
 
344 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 
340 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  35.41 
 
 
338 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  32.52 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  33.33 
 
 
340 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  36.45 
 
 
348 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  33.02 
 
 
340 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  30.51 
 
 
340 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.08 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  32.92 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  33.54 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  33.02 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  32.92 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  33.02 
 
 
340 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  34.19 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  34.63 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 
350 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  33.02 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  32.2 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  34.65 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  31.48 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  34.67 
 
 
337 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.29 
 
 
340 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
340 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 
341 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  31.71 
 
 
341 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  33.44 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.49 
 
 
381 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  34.67 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  32.39 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 
344 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 
355 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  31.37 
 
 
331 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  31.95 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.82 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.82 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  36.14 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.72 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  36.78 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.73 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  34.59 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  37.82 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.16 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  32.24 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  34.52 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  41.84 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  41.84 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  37.07 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  31.08 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  39.6 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  30.98 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.88 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.2 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  45.35 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 
341 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  34.43 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.61 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.43 
 
 
346 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.08 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  38.37 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.96 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  27.96 
 
 
340 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  22.89 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.81 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.15 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  26.29 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.29 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.43 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.79 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.76 
 
 
127 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  33 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  28.98 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.39 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.87 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  30.58 
 
 
343 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  30.58 
 
 
345 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.39 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  31.5 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  30.77 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  27.68 
 
 
388 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  30.86 
 
 
310 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  28.18 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.94 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.95 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>