More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2267 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
391 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  52.59 
 
 
405 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  58.43 
 
 
388 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  55.5 
 
 
387 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  44.33 
 
 
389 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  49.86 
 
 
396 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  46.97 
 
 
395 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  50.14 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  50.14 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  45.56 
 
 
413 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  31.23 
 
 
369 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  31.78 
 
 
369 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  29.3 
 
 
366 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  27.6 
 
 
362 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  27.27 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  25.95 
 
 
368 aa  116  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  26.05 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.28 
 
 
353 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.01 
 
 
365 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.66 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.76 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  23.84 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  34.68 
 
 
380 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  27.64 
 
 
439 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.22 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  26.78 
 
 
436 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  26.78 
 
 
436 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  26.78 
 
 
436 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.03 
 
 
334 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.03 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  25.68 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  30.52 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.84 
 
 
331 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.41 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.63 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  26.33 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  24.73 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  31 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  24 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  42.61 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  36.3 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  26.33 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  26.33 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.74 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  26.91 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  25 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.55 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  37.69 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  27.05 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.36 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  39.47 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  39.47 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  32.14 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.88 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.44 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.96 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.42 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  27.68 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  27.33 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  23.19 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  27.03 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.74 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  31.22 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  31.68 
 
 
734 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  33.9 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  36.84 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  38.78 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  33.09 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.3 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  37.72 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.23 
 
 
6889 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  39.8 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  39.8 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  35 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.55 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  35.66 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  35.66 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  27.53 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  24.83 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  44.71 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  29.81 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.38 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  31.68 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  37.04 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  37.84 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.64 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>