More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
322 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  65.47 
 
 
322 aa  384  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1881  luciferase family oxidoreductase, group 1  52.76 
 
 
323 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797974  normal  0.396374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0991  luciferase family protein  53.27 
 
 
323 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2484  Luciferase-like monooxygenase  46.91 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3717  luciferase-like protein  47.59 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0129729  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.13 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.73 
 
 
338 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.69 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 
340 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  38.53 
 
 
328 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.56 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  37.5 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  37.8 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  37.8 
 
 
335 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  38.53 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  40.06 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  37.5 
 
 
335 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  37.97 
 
 
349 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  37.8 
 
 
335 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  38.85 
 
 
331 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
331 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  37.03 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.87 
 
 
341 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  36.94 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  37.96 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  37.34 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  36.62 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.14 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  36.19 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  38.56 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  38.41 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
352 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 
424 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  39.75 
 
 
397 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  36.99 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  39.03 
 
 
355 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  38.05 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  36.81 
 
 
336 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  37.14 
 
 
338 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  36.14 
 
 
341 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  37.8 
 
 
339 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  37.9 
 
 
331 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  37.58 
 
 
335 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  38.41 
 
 
335 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0403  luciferase family protein  37.85 
 
 
328 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  34.04 
 
 
331 aa  168  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  34.81 
 
 
335 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  39.06 
 
 
341 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  34.81 
 
 
335 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  34.81 
 
 
335 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  37.19 
 
 
334 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  37.3 
 
 
327 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  40.13 
 
 
346 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  36.45 
 
 
336 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  34.81 
 
 
335 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  34.49 
 
 
335 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
328 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  34.39 
 
 
333 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  38.56 
 
 
343 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  36.56 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  36.45 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  34.6 
 
 
335 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  39.38 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  36.96 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1714  luciferase family protein  33.83 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1681  luciferase family protein  33.83 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0466  putative soluble lytic murein transglycosylase  32.46 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.356874  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  38.72 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  37.2 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  36.31 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  38.24 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  36.88 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  37.26 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.54 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  39.75 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  32.32 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  36.56 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  38.17 
 
 
332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  35.42 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37.22 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  36.48 
 
 
335 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  35.91 
 
 
350 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  37.54 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  36.25 
 
 
335 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  37.54 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  34.29 
 
 
335 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  34.29 
 
 
335 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>