More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4198 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
376 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  50.85 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  38.27 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.84 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.59 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.3 
 
 
352 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.78 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.56 
 
 
358 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.35 
 
 
347 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
346 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 
334 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
346 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.67 
 
 
354 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.38 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.51 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.51 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.89 
 
 
341 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.83 
 
 
331 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 
334 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.38 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.14 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.33 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.38 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  28.53 
 
 
346 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.78 
 
 
352 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.91 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.09 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  27.49 
 
 
343 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.96 
 
 
347 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.57 
 
 
355 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.27 
 
 
348 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.07 
 
 
345 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  25.54 
 
 
438 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  29.75 
 
 
345 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.86 
 
 
345 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.43 
 
 
380 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  27.41 
 
 
3337 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 
328 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25 
 
 
328 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.03 
 
 
345 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.14 
 
 
371 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.36 
 
 
346 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 
372 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
281 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  30.54 
 
 
354 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
330 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.86 
 
 
345 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 
386 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.67 
 
 
345 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.06 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  24.14 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.74 
 
 
361 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.54 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.52 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.31 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  23.19 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  23.19 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.61 
 
 
342 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  26.59 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.55 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
422 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  27.16 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  29.48 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  23.48 
 
 
351 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  34.36 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 
329 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
379 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  22.9 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.78 
 
 
309 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  24.86 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.76 
 
 
311 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  24.93 
 
 
367 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  34.08 
 
 
290 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  28.01 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  33.76 
 
 
282 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  22.67 
 
 
351 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  23.84 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  24.69 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  23.41 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.89 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  25.87 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  23.84 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.15 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28.84 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.76 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  23.84 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  22.9 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  26.74 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.15 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  28.83 
 
 
1519 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.03 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  23.55 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.03 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  37.59 
 
 
290 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>