More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7516 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  100 
 
 		 345 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  72.73 
 
 		 363 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  66.67 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  67.16 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  65.31 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  67.06 
 
 		 358 aa  464  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  67.74 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  64.91 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.01 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  61.34 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.11 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  58.88 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  58.88 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  46.75 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  51.45 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  48.97 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  50.88 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  50.43 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  50.29 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  47.21 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  50.45 
 
 		 355 aa  298  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  44.9 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  47.21 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  48.55 
 
 		 367 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  50.43 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  44.87 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  43.11 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  45.32 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  46.61 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  46.76 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  47.54 
 
 		 348 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  47.25 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  45.75 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.43 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  42.82 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  39.77 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  41.47 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  35.86 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  36.44 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  35.55 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  36.02 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  35.73 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  35.73 
 
 		 352 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  35.26 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  35.16 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  35.16 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  34.97 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  37.39 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  37.39 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.81 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  33.33 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  32.65 
 
 		 734 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.54 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  32.92 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.53 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.39 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  27.7 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.28 
 
 		 145 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  28.74 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  29.34 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  28.65 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  30.09 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.33 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.89 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 369 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.02 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.21 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.23 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.08 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  28.53 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  27.78 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  26.44 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.82 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  26.9 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.12 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  28.19 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  28.16 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  25.44 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.47 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.18 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.08 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.95 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.35 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.86 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>