More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3123 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  94.05 
 
 
353 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
354 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  80.87 
 
 
347 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  77.78 
 
 
352 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  60.91 
 
 
356 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  63.29 
 
 
355 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  62.57 
 
 
345 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  62.94 
 
 
367 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  61.95 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  57.35 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  53.22 
 
 
345 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  54.97 
 
 
342 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  56.1 
 
 
344 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  51.75 
 
 
343 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  50 
 
 
347 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  53.67 
 
 
340 aa  358  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  53.82 
 
 
367 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  53.96 
 
 
377 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  55.56 
 
 
344 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  51.73 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  53.6 
 
 
348 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  53.31 
 
 
348 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  50.29 
 
 
340 aa  332  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  50.88 
 
 
345 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  49.17 
 
 
364 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  50.29 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.28 
 
 
347 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  48.86 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  48.55 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  47.66 
 
 
343 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.26 
 
 
345 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  45.95 
 
 
366 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  46.2 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  46.2 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  46.02 
 
 
330 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  40.88 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  40.88 
 
 
351 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  40.88 
 
 
352 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  40.23 
 
 
351 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  40.29 
 
 
351 aa  262  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  40.29 
 
 
351 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  40.29 
 
 
351 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  39.71 
 
 
351 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  39.71 
 
 
352 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  39.94 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  40.87 
 
 
353 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  40.87 
 
 
353 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.33 
 
 
358 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  35.74 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.95 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  35.63 
 
 
734 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 
359 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.12 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  28.99 
 
 
378 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  30.86 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
369 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 
357 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.28 
 
 
145 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.31 
 
 
365 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
374 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  27.83 
 
 
374 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 
349 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  28.45 
 
 
371 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.45 
 
 
366 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.73 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  28.65 
 
 
352 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  28.82 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  28.53 
 
 
388 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
371 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.71 
 
 
381 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  28.16 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.43 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  27.38 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  27.09 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  27.17 
 
 
380 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.82 
 
 
377 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  28.16 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  27.64 
 
 
481 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.06 
 
 
384 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  32.99 
 
 
374 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.97 
 
 
331 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.39 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.07 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.18 
 
 
402 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.62 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.19 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.99 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.71 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  33.16 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 
1107 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>