More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3319 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  100 
 
 
340 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  68.53 
 
 
340 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  69.03 
 
 
340 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  57.18 
 
 
345 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  59.36 
 
 
344 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  53.69 
 
 
342 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  56.89 
 
 
348 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  56.6 
 
 
348 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  49.12 
 
 
352 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  50.44 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  50.44 
 
 
353 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  52.06 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  46.53 
 
 
345 aa  325  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  49.12 
 
 
347 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  51.11 
 
 
356 aa  318  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  47.18 
 
 
377 aa  315  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  48.1 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  46.73 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  43.9 
 
 
343 aa  311  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  48.53 
 
 
355 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  49.71 
 
 
355 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  45.59 
 
 
350 aa  305  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  45.61 
 
 
345 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  45.32 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  46.4 
 
 
344 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  45.1 
 
 
358 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.82 
 
 
347 aa  299  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  42.4 
 
 
347 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  43.7 
 
 
366 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  43.95 
 
 
363 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.32 
 
 
345 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  41.59 
 
 
343 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  41.18 
 
 
343 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  41.18 
 
 
345 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  42.98 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  42.11 
 
 
351 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  42.98 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  42.69 
 
 
351 aa  271  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  42.69 
 
 
352 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  44.3 
 
 
351 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  42.4 
 
 
351 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  42.4 
 
 
351 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  42.2 
 
 
351 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  42.98 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  42.03 
 
 
349 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
364 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  42.11 
 
 
330 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  44.2 
 
 
353 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  44.2 
 
 
353 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  32.65 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  35.84 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  34.05 
 
 
357 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
359 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  33.02 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  32.41 
 
 
361 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  34.26 
 
 
734 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.21 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 
377 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 
387 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
369 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  31.1 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  31.68 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
349 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  30.72 
 
 
352 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  30.62 
 
 
371 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 
374 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  28.86 
 
 
378 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 
382 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  30.39 
 
 
380 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  30.84 
 
 
376 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  27.99 
 
 
396 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.13 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  29.07 
 
 
388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  27.7 
 
 
365 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  29.64 
 
 
377 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 
386 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  30.29 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.9 
 
 
396 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.29 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  32.28 
 
 
481 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.87 
 
 
384 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
376 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.32 
 
 
367 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  27.83 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.34 
 
 
145 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.96 
 
 
353 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.48 
 
 
402 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 
386 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.56 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.69 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.35 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  28.09 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.78 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.19 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>