More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1932 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  100 
 
 
396 aa  802    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  70.2 
 
 
371 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  69.23 
 
 
366 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  69.94 
 
 
372 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  68.66 
 
 
382 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  68.54 
 
 
365 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  67.76 
 
 
369 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  65.72 
 
 
378 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  65.16 
 
 
369 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  68.54 
 
 
371 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  62.47 
 
 
374 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  66.57 
 
 
376 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  64.87 
 
 
380 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.07 
 
 
387 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  66.29 
 
 
367 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  63.32 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.14 
 
 
381 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  64.27 
 
 
367 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  64.92 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  62.82 
 
 
410 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  63.53 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  65.44 
 
 
374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  67.7 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  64.29 
 
 
384 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  64.23 
 
 
377 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.95 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  63.56 
 
 
376 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  41.11 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.62 
 
 
377 aa  222  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  40.69 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  40.75 
 
 
374 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  38.66 
 
 
734 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  39.48 
 
 
361 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  38.78 
 
 
352 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.53 
 
 
365 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  33.04 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 
351 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  29.57 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  29.86 
 
 
352 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
351 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  37.01 
 
 
355 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  29.28 
 
 
351 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  29.28 
 
 
351 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 
356 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  34.55 
 
 
367 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  28.7 
 
 
351 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  28.7 
 
 
351 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 
364 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  28.02 
 
 
351 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  31.75 
 
 
352 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  28.57 
 
 
353 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  28.57 
 
 
353 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 
349 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  33.72 
 
 
330 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  28.41 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  34.99 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  32.04 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.86 
 
 
342 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 
345 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
344 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.89 
 
 
358 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  32.76 
 
 
345 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 
340 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  34.67 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.55 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.09 
 
 
345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  27.99 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.57 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.37 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.6 
 
 
345 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.38 
 
 
345 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  32.38 
 
 
343 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  32.76 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  30.09 
 
 
345 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
353 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  26.51 
 
 
343 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  30.66 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  30.84 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
345 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  30.31 
 
 
347 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  28.21 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  32.57 
 
 
350 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.23 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.37 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.29 
 
 
145 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  26.63 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24.62 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  23.88 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.66 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  31.06 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26.69 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.37 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.21 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.37 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>