More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2185 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  100 
 
 
345 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  43.77 
 
 
356 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  40.23 
 
 
352 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  43.39 
 
 
349 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  43.6 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  41.57 
 
 
347 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.49 
 
 
364 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  43.97 
 
 
367 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  41.47 
 
 
355 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  40.87 
 
 
345 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  39.77 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  36.99 
 
 
345 aa  232  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  40.12 
 
 
353 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  37.68 
 
 
347 aa  229  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  38.08 
 
 
350 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  39 
 
 
377 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  35.16 
 
 
343 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  39.82 
 
 
363 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  38.71 
 
 
367 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.3 
 
 
347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.94 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  42.68 
 
 
342 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  39.36 
 
 
345 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  39.53 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  36.05 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  38.19 
 
 
358 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  37.65 
 
 
340 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  38.19 
 
 
343 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  38.19 
 
 
345 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  39 
 
 
330 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  37.21 
 
 
366 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  37.18 
 
 
343 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 
351 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  33.53 
 
 
352 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 
340 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  32.84 
 
 
351 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  32.65 
 
 
351 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32.94 
 
 
351 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32.94 
 
 
351 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  32.35 
 
 
351 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  38.15 
 
 
348 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  37.86 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  32.75 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  32.65 
 
 
340 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 
344 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  32.65 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  33.14 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  33.14 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 
357 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.65 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.84 
 
 
358 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.15 
 
 
361 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.7 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 
374 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  28.32 
 
 
374 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.73 
 
 
365 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  29.77 
 
 
371 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.48 
 
 
366 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  28.03 
 
 
369 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  32.04 
 
 
734 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.48 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  29.6 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.74 
 
 
396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  29.39 
 
 
388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.68 
 
 
352 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
386 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  28.12 
 
 
367 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.68 
 
 
384 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  29.57 
 
 
369 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.21 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  28.57 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.11 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  26.38 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  29.52 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.31 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.12 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 
371 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 
376 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.7 
 
 
145 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  28.57 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.47 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.42 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.25 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.28 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  24.62 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.43 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24.34 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  23.49 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  27.51 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.88 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>