More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  86.93 
 
 
371 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
366 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  84.08 
 
 
374 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  84.7 
 
 
372 aa  617  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  85.24 
 
 
369 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  83.48 
 
 
382 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  80.39 
 
 
365 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  82.96 
 
 
371 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  81.42 
 
 
367 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  79.22 
 
 
380 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  81.72 
 
 
381 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  74.86 
 
 
369 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  77.09 
 
 
376 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.49 
 
 
387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  75.21 
 
 
374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  76.47 
 
 
384 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  79.94 
 
 
374 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  75.71 
 
 
367 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  79.67 
 
 
386 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  76.94 
 
 
377 aa  554  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  75.79 
 
 
388 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  73.61 
 
 
410 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  70.94 
 
 
378 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.79 
 
 
396 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  74.25 
 
 
376 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  75.75 
 
 
481 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  69.23 
 
 
396 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  38.42 
 
 
377 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  37.33 
 
 
359 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.75 
 
 
734 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 
357 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.8 
 
 
365 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  38.33 
 
 
361 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  36.62 
 
 
374 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.92 
 
 
352 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.04 
 
 
351 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.75 
 
 
351 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  35.74 
 
 
349 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  32.46 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  32.45 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  32.46 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  31.87 
 
 
351 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  30.97 
 
 
351 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  31.87 
 
 
351 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  31.87 
 
 
351 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  32.46 
 
 
352 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  32.4 
 
 
364 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.01 
 
 
355 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
356 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  29.74 
 
 
353 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  29.74 
 
 
353 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  35.09 
 
 
355 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  32.57 
 
 
340 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.36 
 
 
330 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.75 
 
 
358 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  33.81 
 
 
367 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.88 
 
 
358 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.09 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.26 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  30.68 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 
344 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.52 
 
 
347 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
340 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  31.59 
 
 
345 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 
349 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  26.45 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.48 
 
 
345 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.13 
 
 
340 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
345 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30.09 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  28.86 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
348 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  31.41 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  26.7 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
353 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.67 
 
 
377 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  29.02 
 
 
347 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
345 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  29.89 
 
 
345 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  34.26 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  30.75 
 
 
363 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  29.77 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  28.78 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  29.48 
 
 
343 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  27.73 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.87 
 
 
331 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.71 
 
 
145 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.63 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.15 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.47 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.16 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.47 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  28.27 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  30.36 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  28.51 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.44 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>