More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1252 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  100 
 
 		 367 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  66.95 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  69.89 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  68.64 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  63.24 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  62.94 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  59.59 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  62.61 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  60.63 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  56.3 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  52.17 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  49.42 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  52.02 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  51.61 
 
 		 340 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  53.85 
 
 		 342 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  55.39 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  52.06 
 
 		 340 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  52.24 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  49.85 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  54.34 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  54.62 
 
 		 348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  51.18 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  49.71 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  52.29 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  55.43 
 
 		 344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  48.55 
 
 		 345 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  47.78 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  48.09 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  49.57 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  48.1 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.75 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  43.73 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.13 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  44.64 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  46.2 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  42.61 
 
 		 351 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  44.6 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  45.91 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  43.02 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  42.61 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  42.61 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  43.3 
 
 		 351 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  42.33 
 
 		 351 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  42.33 
 
 		 351 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  42.77 
 
 		 351 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  43.02 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  42.78 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  42.78 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  43.97 
 
 		 345 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  34.11 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  32.84 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  34.03 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.9 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  34.55 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.83 
 
 		 734 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  32.58 
 
 		 378 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  33.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  32.73 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.54 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.91 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  30.91 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  31.64 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  30.64 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  30.9 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  30.64 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  32.47 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.55 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  55.64 
 
 		 145 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  31.21 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.61 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  29.43 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.86 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.97 
 
 		 381 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  31.93 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  30.46 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.42 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  31.07 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  28.86 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.61 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  30.17 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.67 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.35 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.49 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.53 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.26 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.06 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.53 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.59 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.37 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>