More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5363 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  100 
 
 
481 aa  988    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  80.12 
 
 
371 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  82.3 
 
 
372 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.49 
 
 
366 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  74.93 
 
 
382 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  72.91 
 
 
376 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  76.09 
 
 
374 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  75.47 
 
 
374 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  74.84 
 
 
369 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  78.88 
 
 
369 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  74.53 
 
 
365 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  73.49 
 
 
371 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  77.95 
 
 
381 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  76.71 
 
 
367 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  70.5 
 
 
378 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  72.36 
 
 
367 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  72.98 
 
 
380 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  70.89 
 
 
374 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  70.19 
 
 
410 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  70.95 
 
 
388 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  74.22 
 
 
386 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.15 
 
 
384 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  69.25 
 
 
387 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  71.43 
 
 
377 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.73 
 
 
396 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  67.7 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  71.21 
 
 
376 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  39.12 
 
 
359 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  40.58 
 
 
377 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.36 
 
 
734 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  73.94 
 
 
205 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.66 
 
 
365 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  38.78 
 
 
361 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  38.76 
 
 
374 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  41.2 
 
 
349 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  36.89 
 
 
352 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  56.38 
 
 
430 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  62.26 
 
 
211 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  60.62 
 
 
200 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
351 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.23 
 
 
351 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  32.62 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  63.57 
 
 
206 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32.32 
 
 
351 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32.32 
 
 
351 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  56.89 
 
 
208 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  60.56 
 
 
224 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  32.92 
 
 
351 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  54.72 
 
 
208 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  32.01 
 
 
351 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  32.12 
 
 
351 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  61.73 
 
 
199 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  56.71 
 
 
197 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  55.36 
 
 
228 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  33.93 
 
 
355 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  32.62 
 
 
352 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  30.34 
 
 
340 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  30.47 
 
 
353 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  30.47 
 
 
353 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  53.33 
 
 
218 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 
206 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  53.18 
 
 
252 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 
355 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 
356 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  52.73 
 
 
203 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.6 
 
 
358 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  29.28 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 
330 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  28.1 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  31.87 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  48.68 
 
 
232 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  30.22 
 
 
345 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.65 
 
 
358 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  32.54 
 
 
366 aa  133  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  31.93 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.52 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  51.52 
 
 
210 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.9 
 
 
345 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  46.82 
 
 
229 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 
367 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  28.49 
 
 
352 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.21 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  32.28 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  55.47 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.08 
 
 
377 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  56.91 
 
 
205 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  30.65 
 
 
348 aa  126  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 
345 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
348 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
349 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  32.87 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  31.01 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  27.64 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  29.59 
 
 
345 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28.19 
 
 
345 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.89 
 
 
345 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>