154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2598 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
199 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  65.22 
 
 
206 aa  227  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  58.42 
 
 
211 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  58.67 
 
 
200 aa  203  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  53.62 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  56.02 
 
 
218 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  55.94 
 
 
430 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  57.35 
 
 
228 aa  194  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  62.78 
 
 
205 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  61.11 
 
 
197 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  62.43 
 
 
219 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  55.88 
 
 
203 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 
224 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  57.54 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  49.51 
 
 
208 aa  177  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  56.73 
 
 
210 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  52.45 
 
 
208 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  56.68 
 
 
252 aa  168  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  61.73 
 
 
481 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  60.38 
 
 
205 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  46.86 
 
 
229 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  45.88 
 
 
224 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  47.16 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  43.56 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  40.85 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  44.51 
 
 
197 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  43.79 
 
 
186 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  40.12 
 
 
186 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  43.1 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  41.24 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  40.12 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  40.12 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  43.71 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  42.86 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  42.61 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.29 
 
 
186 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.29 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  41.32 
 
 
186 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  40.78 
 
 
187 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  42.17 
 
 
193 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  37.8 
 
 
186 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  37.8 
 
 
186 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  37.04 
 
 
192 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  41.33 
 
 
194 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
190 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
187 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  40.65 
 
 
194 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  39.56 
 
 
187 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  42.68 
 
 
186 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 
221 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  39.29 
 
 
180 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  41.33 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 
184 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  39.46 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
190 aa  94.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  34.83 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  40.76 
 
 
193 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  33.89 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  39.86 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  35.18 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  36.6 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  29.48 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  30.06 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  40.65 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  37.96 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  37.86 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  37.65 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  40.22 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  38.54 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  39.58 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>