147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2905 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  99.46 
 
 
186 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  100 
 
 
186 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  79.14 
 
 
187 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  66.13 
 
 
186 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  60.33 
 
 
221 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  64.37 
 
 
191 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  63.22 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  58.89 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  217  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  217  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  63.22 
 
 
186 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  61.11 
 
 
186 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  62.9 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  58.24 
 
 
187 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  54.24 
 
 
193 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  56.98 
 
 
209 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  53.71 
 
 
197 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  57.71 
 
 
193 aa  189  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  53.98 
 
 
193 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  52.57 
 
 
193 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  63.92 
 
 
189 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
194 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  51.88 
 
 
180 aa  174  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  47.85 
 
 
186 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 
190 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  55.92 
 
 
186 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  55.92 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  42.54 
 
 
186 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  46.63 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  41.92 
 
 
184 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 
194 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
190 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  47.44 
 
 
189 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  47.44 
 
 
189 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  49.04 
 
 
193 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  46.79 
 
 
195 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  48.65 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  49.06 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  46.62 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  41.42 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  43.6 
 
 
187 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  43.43 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  40.88 
 
 
192 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
176 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  41.52 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  38.24 
 
 
200 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  39.87 
 
 
430 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  38.98 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
252 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
206 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  34.43 
 
 
211 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 
218 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
208 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  39.08 
 
 
203 aa  104  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  39.19 
 
 
199 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  35.5 
 
 
229 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
218 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
228 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 
210 aa  94.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  31.07 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 
208 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  41.03 
 
 
481 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.55 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  35.37 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.62 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  31.03 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.8 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.76 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.36 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  43.42 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.14 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>