220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3233 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  94.3 
 
 		 193 aa  366  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  65.54 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  67.23 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  66.1 
 
 		 197 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  67.23 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  63.04 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  63.04 
 
 		 197 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  62.01 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  67.23 
 
 		 197 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  60.45 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  66.04 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  59.32 
 
 		 191 aa  199  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.63 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.37 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  58.76 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.76 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.06 
 
 		 191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  42.53 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  45.98 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  45.4 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  41.46 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  44.83 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  46.67 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  46.98 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  45.4 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  43.35 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  36.57 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  52.21 
 
 		 407 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  45.52 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  32.37 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  35.25 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  36.72 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  32.26 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  32.26 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  31.51 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  31.51 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  40.62 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  34.59 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  31.43 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  35.4 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  33.99 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  32.34 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  40.43 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  36.36 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.23 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  40.7 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  39.51 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  30.59 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  35.88 
 
 		 481 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  35.35 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  35.35 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  39.24 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  35.35 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  36.17 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  36.27 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  33.1 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  37.35 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  32.03 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>