153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4212 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  54.71 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  53.89 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  54.6 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  48.11 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  47.03 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  52.35 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  52.05 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  45.41 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  50.32 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  46.58 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  49.68 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  49.68 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  41.32 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  39.39 
 
 		 209 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  40.72 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  39.52 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  38.15 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  37.79 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.32 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  39.66 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  39.66 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  42.17 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.32 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  41.5 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  42.17 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  39.52 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  39.23 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  39.08 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  38.95 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  39.08 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  36.26 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  35.84 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  40 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  37.11 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  35.8 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  37.84 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  36.94 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  35.2 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  33.71 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  32.28 
 
 		 229 aa  101  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  33.91 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  34.25 
 
 		 232 aa  98.2  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  33.76 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  34.5 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 252 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 430 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  42.57 
 
 		 481 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 		 228 aa  87.8  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.89 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.96 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.2 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  26.7 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  28.57 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  28.16 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  26.7 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>