146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  100 
 
 
219 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  62.07 
 
 
197 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  56 
 
 
200 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  61.11 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  56.57 
 
 
203 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  53.47 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  49.09 
 
 
218 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  53.65 
 
 
206 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  56.25 
 
 
205 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  55.11 
 
 
211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  56.04 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  52.84 
 
 
206 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  53.25 
 
 
224 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  51.12 
 
 
210 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  59.87 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
430 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  50 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  54.24 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  50.28 
 
 
229 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  43.55 
 
 
208 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  48.02 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  47.06 
 
 
186 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  46.15 
 
 
191 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  45.68 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  44.72 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  43.89 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  43.89 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  47.2 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  43.58 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  44.08 
 
 
224 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  45.91 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  45.4 
 
 
186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  41.71 
 
 
186 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  41.71 
 
 
186 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  55.47 
 
 
481 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
190 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  46 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  44.38 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  43.27 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  41.52 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  41.94 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  41.52 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  41.72 
 
 
194 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  43.62 
 
 
186 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  40.94 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  44.06 
 
 
180 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  41.83 
 
 
186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  49.52 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  51.4 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  40.24 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  42.58 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  50.93 
 
 
192 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  50.86 
 
 
187 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  43.05 
 
 
189 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  43.05 
 
 
189 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  34.57 
 
 
186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  41.29 
 
 
202 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  40.23 
 
 
187 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  43.05 
 
 
195 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  33.51 
 
 
186 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 
193 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  51.52 
 
 
195 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  49.04 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
184 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  34.3 
 
 
176 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  40.14 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  44.66 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  41.6 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  35.86 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  45.16 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  47.67 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  35.34 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  37.69 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.25 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>