152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2040 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  78.19 
 
 
197 aa  307  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  77.49 
 
 
193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  74.48 
 
 
193 aa  287  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  73.03 
 
 
180 aa  262  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  64.77 
 
 
194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  63.64 
 
 
192 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  60.23 
 
 
191 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  63.33 
 
 
186 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  59.66 
 
 
186 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  59.66 
 
 
186 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  59.89 
 
 
187 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  59.32 
 
 
186 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  59.09 
 
 
186 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  57.63 
 
 
186 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  57.95 
 
 
186 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  53.01 
 
 
187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  54.24 
 
 
186 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  54.24 
 
 
186 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  60.13 
 
 
189 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  49.17 
 
 
221 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  50 
 
 
209 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  54.24 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  49.08 
 
 
186 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  49.08 
 
 
186 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  41.62 
 
 
186 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
211 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
187 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
194 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  40.33 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  44.03 
 
 
186 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  42.77 
 
 
186 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  47.44 
 
 
189 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  47.44 
 
 
189 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  43.45 
 
 
190 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  46.41 
 
 
202 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  46.79 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
185 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  46.41 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
185 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  40.35 
 
 
184 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  44.87 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
195 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  44.72 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  40 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  43.95 
 
 
430 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  38.37 
 
 
229 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
176 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
192 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  40.67 
 
 
252 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  37.2 
 
 
211 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
206 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
199 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  37.66 
 
 
218 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  37.24 
 
 
232 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
197 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
206 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  35.59 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  45.92 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  38.75 
 
 
210 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 
207 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  50 
 
 
481 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 
224 aa  85.5  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  50 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  39.85 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  43.62 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  45.78 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  35.98 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  33.75 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.23 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.76 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  43.84 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.76 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.76 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.53 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  33.1 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.02 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.8 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>