192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3597 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
195 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  96 
 
 
189 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  96 
 
 
189 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  72.88 
 
 
193 aa  249  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  73.18 
 
 
193 aa  248  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  65.54 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  66.01 
 
 
202 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  61.45 
 
 
194 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  56.67 
 
 
211 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  57.31 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  48.57 
 
 
190 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  50 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  44.2 
 
 
186 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  45.51 
 
 
186 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  50.57 
 
 
187 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 
185 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  48.15 
 
 
186 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  46.24 
 
 
186 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  45.66 
 
 
186 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  48.86 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  46.25 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  46.63 
 
 
186 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  46.99 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  46.01 
 
 
191 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  46.99 
 
 
192 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  45.06 
 
 
186 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  45.06 
 
 
186 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  45.06 
 
 
186 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  46.63 
 
 
186 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  47.27 
 
 
193 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  44.85 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  46.06 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
176 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  43.01 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  46.05 
 
 
194 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  43.64 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  45.18 
 
 
187 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  44.52 
 
 
189 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  43.59 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  39.9 
 
 
224 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  43.23 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  43.23 
 
 
186 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  37.64 
 
 
180 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  41.21 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  46.36 
 
 
193 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  42.7 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  36 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 
218 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
218 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
208 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
206 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  40.62 
 
 
200 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
430 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  44.04 
 
 
252 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  37.7 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  32.81 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  39.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
198 aa  87.8  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  42.5 
 
 
481 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  36.6 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  39.73 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  32.76 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  40.43 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.11 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  39.05 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  43.06 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>