200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3404 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  95.53 
 
 		 195 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  73.86 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  74.16 
 
 		 193 aa  250  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  64.25 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  60.84 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  66.01 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  57.31 
 
 		 211 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  57.31 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  48.57 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  50.84 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  48.21 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  47.31 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  48.15 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  46.24 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  46.88 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  47.28 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  46.24 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  48.19 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  47.85 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  47.24 
 
 		 191 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  46.01 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  46.01 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  47.88 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  46.01 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  47.85 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  46.39 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  43.35 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  42.02 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  46.06 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  45.75 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  42.22 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  44.23 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  45.81 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  45.18 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  38.32 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  43.87 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  43.87 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  46.21 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  42.6 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  35.43 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  39.64 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 430 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 218 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  37.02 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  44.04 
 
 		 252 aa  97.1  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  39.19 
 
 		 229 aa  94.4  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  33.69 
 
 		 232 aa  93.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  36.16 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  43.81 
 
 		 481 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  39.73 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.14 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  32.3 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.97 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  37.38 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.54 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.29 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  40.43 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.11 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.11 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  39.05 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.04 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  34.55 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  43.66 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>