162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3915 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  100 
 
 
187 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  79.14 
 
 
186 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  79.14 
 
 
186 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  73.22 
 
 
186 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  72.07 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  64.17 
 
 
221 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  64.25 
 
 
191 aa  230  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  62.57 
 
 
187 aa  227  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  64.37 
 
 
186 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  64.94 
 
 
186 aa  220  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  63.79 
 
 
186 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  63.79 
 
 
186 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  64.37 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  61.71 
 
 
193 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  59.43 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  60.23 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  58.86 
 
 
193 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  58.86 
 
 
197 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  60.1 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  60.23 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  57.71 
 
 
194 aa  197  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  58.75 
 
 
180 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  63.29 
 
 
189 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  48.86 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  48.86 
 
 
186 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  45.29 
 
 
190 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  46.88 
 
 
186 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  46.78 
 
 
194 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 
190 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  44.38 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  43.11 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  46.58 
 
 
186 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  44.89 
 
 
211 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  49.67 
 
 
202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  48.72 
 
 
189 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  48.72 
 
 
189 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  49.36 
 
 
193 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  47.44 
 
 
195 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  49.02 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  45.35 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  41.52 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  39.52 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  40.23 
 
 
200 aa  120  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  44.38 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 
192 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
206 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  39.31 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  37.87 
 
 
252 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 
430 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  36.16 
 
 
229 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  40.79 
 
 
199 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
206 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  35.43 
 
 
211 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 
218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  40.27 
 
 
197 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  35.03 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  39.11 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
228 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
218 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  37.65 
 
 
210 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  50 
 
 
481 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  32.7 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.53 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  42.17 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.1 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.36 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  33.92 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.36 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.05 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  44.83 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>