181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2620 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
177 aa  356  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
188 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 
212 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.03 
 
 
197 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.6 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.24 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.24 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  42.33 
 
 
193 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.46 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.68 
 
 
197 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.68 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  42.86 
 
 
197 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.97 
 
 
197 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
207 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
207 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  38.1 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.55 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.48 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.07 
 
 
191 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.82 
 
 
191 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.24 
 
 
191 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  44.68 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  38.06 
 
 
189 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
196 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.72 
 
 
195 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.66 
 
 
171 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
181 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.42 
 
 
214 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
197 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
407 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
172 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  30.46 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  35.25 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  40.7 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  44.87 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  30.82 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
430 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  33.79 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  28.14 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  28.49 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  30.87 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  34.06 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  31.33 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  29.48 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  30.52 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  29.48 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  37.97 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  40.48 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  30.77 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  36.71 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  24.44 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  29.66 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  35.94 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  40.48 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  31.69 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  31.21 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  34.02 
 
 
481 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
205 aa  61.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>