219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1047 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  49.44 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 
196 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
190 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  32 
 
 
209 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  31.64 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  35.84 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  31.64 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  33.91 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  33.91 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  32.26 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  32.26 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  33.53 
 
 
186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
184 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  27.11 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  27.11 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  32.94 
 
 
193 aa  84.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  31.29 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  30.86 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  28.98 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  36.3 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  33.75 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  28.98 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  33.14 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  30.05 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  34.25 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  29.76 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  33.95 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  29.09 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  29.17 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  34.3 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  33.97 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  36.23 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  39.81 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  33.75 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  34.34 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  33.95 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  31.55 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  36.11 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  31.93 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  31.86 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.18 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  36.62 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  30.95 
 
 
229 aa  61.2  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
252 aa  61.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  26.84 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>