202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5415 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  76.65 
 
 
197 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  76.65 
 
 
197 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  75.13 
 
 
197 aa  304  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  76.65 
 
 
197 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  71.57 
 
 
197 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  69.54 
 
 
197 aa  277  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  63.45 
 
 
197 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  65.54 
 
 
193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  65.54 
 
 
193 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  59.9 
 
 
193 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.24 
 
 
184 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.24 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  63.69 
 
 
171 aa  207  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  57.67 
 
 
197 aa  204  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  56.5 
 
 
191 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  56.5 
 
 
191 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  55.93 
 
 
191 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  54.24 
 
 
191 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  45.14 
 
 
212 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
188 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  42.71 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
207 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
207 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
177 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  42.93 
 
 
199 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  46.2 
 
 
196 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  44.75 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  47.95 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  38.24 
 
 
181 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
407 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  41.22 
 
 
181 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  47.01 
 
 
172 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 
184 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  32.97 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  39.39 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
252 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  39.84 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  31.09 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  39.84 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  39.84 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  37.8 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  35.25 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  38.06 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  42.39 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
430 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  44.05 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  40.23 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  32.4 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  43.53 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  39.29 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  42.31 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  35.25 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  34.13 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  43.53 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  35.54 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  40.51 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  40.62 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  40.62 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>