143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2421 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  66.16 
 
 
196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  70.99 
 
 
172 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
207 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  49.11 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  56.36 
 
 
214 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  49.75 
 
 
195 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  50.33 
 
 
212 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.89 
 
 
197 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  59.03 
 
 
407 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.75 
 
 
191 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.93 
 
 
197 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.07 
 
 
197 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  49.37 
 
 
189 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.2 
 
 
193 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  44.51 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.35 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  50 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  44.85 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  45.25 
 
 
197 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
191 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.41 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.71 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.02 
 
 
197 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.02 
 
 
197 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
184 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  43.06 
 
 
181 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
197 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  50.56 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  37.32 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  45.22 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  45.69 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  37.09 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  38.26 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  33.99 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  36.77 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  39.35 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  48.28 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  46.51 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  36.18 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  35.76 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  35.76 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  37.22 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  45.78 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  36.49 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  32.45 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  35.29 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  36.8 
 
 
430 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  36.11 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  43.88 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  42.71 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  33.53 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  35.66 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  29.82 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  33.99 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  33.5 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  35.66 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  39.85 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  34.15 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>