144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2285 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  62 
 
 
206 aa  218  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  58.79 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  61.14 
 
 
200 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  58.38 
 
 
211 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  58.91 
 
 
205 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  57.14 
 
 
203 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  62.07 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  55.17 
 
 
430 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  51.5 
 
 
208 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  60.41 
 
 
199 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  55.19 
 
 
224 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  58.56 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  52.17 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  54 
 
 
208 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  51.92 
 
 
228 aa  171  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  55.23 
 
 
218 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  50 
 
 
232 aa  154  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  58 
 
 
205 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  51 
 
 
210 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  56.21 
 
 
481 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  46.86 
 
 
206 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  45.7 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.98 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  38.42 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  44.22 
 
 
186 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  41.95 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  43.24 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  42.18 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  42.18 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  43.54 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  43.87 
 
 
193 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  42.18 
 
 
191 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  41.5 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 
185 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  37.08 
 
 
186 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  40.54 
 
 
187 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  39.86 
 
 
193 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  38.98 
 
 
221 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  40.25 
 
 
193 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
197 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  43.06 
 
 
194 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
190 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  36.52 
 
 
186 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  41.73 
 
 
193 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  37.09 
 
 
186 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  39.73 
 
 
186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  35.1 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  39.73 
 
 
186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  37.84 
 
 
192 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  38.82 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  39.19 
 
 
187 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  38.16 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  41.13 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  51.69 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  37.41 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  37.75 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  37.75 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  37.75 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  49.38 
 
 
180 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  32.66 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  36.3 
 
 
186 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.74 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.25 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  43.36 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.27 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  42.55 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  47.37 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  38.18 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  43.48 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.1 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>