149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2164 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  100 
 
 
186 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  72.07 
 
 
187 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  70.06 
 
 
186 aa  254  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  62.78 
 
 
187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  62.9 
 
 
186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  62.9 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  63.33 
 
 
193 aa  228  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  62.57 
 
 
221 aa  227  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  61.14 
 
 
197 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  60.89 
 
 
191 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  62.64 
 
 
186 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  60.92 
 
 
186 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  56.28 
 
 
193 aa  207  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  59.09 
 
 
193 aa  207  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  64.6 
 
 
180 aa  207  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  58.29 
 
 
192 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  59.77 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  57.59 
 
 
189 aa  177  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  48.86 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  43.11 
 
 
184 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  45.14 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  45.14 
 
 
186 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  42.5 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  41.61 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  43.12 
 
 
186 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 
190 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  44.23 
 
 
189 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  44.23 
 
 
189 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  42.6 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  43.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  45.75 
 
 
193 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 
193 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  40.24 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  43.59 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  40.8 
 
 
185 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  40.88 
 
 
195 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  36.42 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  41.83 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
252 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  38.46 
 
 
229 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  37.35 
 
 
192 aa  101  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 
206 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  42.68 
 
 
199 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
430 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  34.78 
 
 
211 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  39.35 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
218 aa  97.1  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  35.46 
 
 
176 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  33.99 
 
 
208 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  34.46 
 
 
232 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
218 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  49.51 
 
 
197 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  39.51 
 
 
210 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 
205 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  48.28 
 
 
481 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  36.18 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.65 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.53 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.24 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.24 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.24 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.24 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.24 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.94 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  46.84 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  30.52 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.37 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.9 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  34.56 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  31.91 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>