150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2764 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  99.46 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  57.06 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  60.12 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  55.49 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  55.49 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  54.71 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  54.71 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  54.72 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  53.09 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  56.6 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  55.92 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  55.92 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  48.86 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  50.89 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  50 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  48.84 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  49.08 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  47.4 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  50.9 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  45.14 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  50.65 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  49.34 
 
 		 180 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  51.03 
 
 		 193 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  41.04 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  46.75 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  39.53 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  40.12 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  42.17 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  44.1 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  43.95 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  46.06 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  41.04 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  41.61 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  41.71 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  43.51 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  51.2 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  43.51 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  39.61 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  43.87 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  43.87 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  43.23 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  40.26 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  40.99 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 		 252 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  38.16 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  38.27 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 430 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  38.31 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 		 206 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  32.34 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  37.67 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  33.7 
 
 		 211 aa  91.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  43 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  35.67 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  32.24 
 
 		 232 aa  84.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  41.51 
 
 		 481 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.46 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.13 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  31.03 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.45 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  23.87 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  23.87 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  33.04 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.61 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.93 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.93 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  30.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  29.48 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.51 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>