158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1902 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  63.33 
 
 
191 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  62.78 
 
 
186 aa  243  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  61.67 
 
 
186 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  65.96 
 
 
194 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  61.02 
 
 
186 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  61.02 
 
 
186 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  61.36 
 
 
186 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  61.86 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  61.14 
 
 
193 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  64.2 
 
 
197 aa  227  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  63.64 
 
 
193 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  59.44 
 
 
186 aa  221  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  58.89 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  60 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  59.43 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  54.75 
 
 
186 aa  195  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  58.29 
 
 
186 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  56.32 
 
 
193 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  53.14 
 
 
187 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  55.7 
 
 
189 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  51.11 
 
 
221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  53.09 
 
 
186 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  52.47 
 
 
186 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  46.89 
 
 
209 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  44.31 
 
 
184 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  44.1 
 
 
186 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  43.83 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  45.78 
 
 
194 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  44.44 
 
 
186 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  40.23 
 
 
190 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  43.58 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  46.02 
 
 
187 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  43.58 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  45.86 
 
 
189 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  45.86 
 
 
189 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  46.5 
 
 
195 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  46.05 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  46.05 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  43.92 
 
 
202 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 
224 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
185 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
190 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  40.99 
 
 
195 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  41.94 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  39.31 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  36.93 
 
 
211 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  40.79 
 
 
218 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  39.74 
 
 
430 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 
206 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
199 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  43.22 
 
 
192 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 
252 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  36.18 
 
 
176 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
218 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  34.67 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 
228 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
208 aa  94.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  43.36 
 
 
481 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  32.48 
 
 
232 aa  84.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  39.53 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  39.64 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.44 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.1 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  30.87 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  38 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  37.85 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  35.65 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  30.52 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.38 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  33.06 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  33.06 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>