134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0568 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
430 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  65.05 
 
 
205 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  59.8 
 
 
206 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  54.46 
 
 
211 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  56.28 
 
 
200 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 
206 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  58.24 
 
 
218 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  52.5 
 
 
203 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  55.37 
 
 
224 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  49.75 
 
 
208 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  55.72 
 
 
197 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  55.94 
 
 
199 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  45.87 
 
 
252 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  56.38 
 
 
481 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  54.39 
 
 
210 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
228 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  48.79 
 
 
229 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  57.23 
 
 
205 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  48.53 
 
 
208 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  48.3 
 
 
232 aa  160  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  50 
 
 
219 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  46.59 
 
 
206 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 
224 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  41.83 
 
 
193 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  39.87 
 
 
186 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  41.29 
 
 
197 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  41.67 
 
 
193 aa  113  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  38.6 
 
 
186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  40.48 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  40 
 
 
187 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  39.22 
 
 
186 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  39.05 
 
 
186 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  45.75 
 
 
193 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  38.46 
 
 
186 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  38.46 
 
 
186 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
193 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  40.84 
 
 
193 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  39.47 
 
 
191 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  41.72 
 
 
194 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
190 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  37.14 
 
 
186 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  37.14 
 
 
186 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  38.85 
 
 
192 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  37.79 
 
 
187 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.79 
 
 
194 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  39.33 
 
 
189 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  38.06 
 
 
186 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  37.22 
 
 
211 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  40 
 
 
186 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  34.97 
 
 
186 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
185 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  39.22 
 
 
186 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  38.46 
 
 
180 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
190 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 
202 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
184 aa  96.3  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  48 
 
 
187 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  39.87 
 
 
189 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  34.68 
 
 
193 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  39.87 
 
 
189 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  41.1 
 
 
195 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
185 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
176 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  39.17 
 
 
186 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  38.33 
 
 
186 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  37.66 
 
 
195 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
218 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
197 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.8 
 
 
191 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  37.12 
 
 
192 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  54.17 
 
 
212 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  36.8 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  39.07 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  37.06 
 
 
197 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
197 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.86 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  34.23 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.39 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
197 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
197 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
177 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.37 
 
 
171 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>