208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4303 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
212 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  48.85 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.14 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  47.43 
 
 
193 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  49.42 
 
 
207 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  49.42 
 
 
207 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  49.44 
 
 
197 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 
177 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.86 
 
 
193 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
407 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.14 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.29 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  50.33 
 
 
199 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.29 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.29 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  52.27 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  48.75 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.11 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.26 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  48.1 
 
 
197 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.94 
 
 
191 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  45.9 
 
 
181 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  53.74 
 
 
197 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  50.67 
 
 
181 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  44.38 
 
 
191 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
196 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
193 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.43 
 
 
184 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  47.16 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  51.05 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
184 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.7 
 
 
171 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  57.14 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  58.75 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  51.65 
 
 
170 aa  85.1  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  40.82 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  36.99 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  40.18 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  42.71 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  46.32 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  46.94 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  44.66 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  54.17 
 
 
430 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  48.05 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  42.96 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  35 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  37.32 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  36.92 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  34.25 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  50 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  43.36 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  33.54 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  41.11 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  37.96 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  38.82 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  37.58 
 
 
160 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  40.62 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  34.22 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  36.91 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  38.1 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  34.22 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  41.96 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  50.79 
 
 
481 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  45.35 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  50.77 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  36.71 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  35.26 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>