131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6432 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  53.53 
 
 		 153 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  53.53 
 
 		 153 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 		 153 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  48.32 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  46.02 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0427  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3775  NADPH-dependent FMN reductase  44.13 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.436385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  40.46 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  45.51 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  44.94 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  41.1 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  43.5 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2918  NADPH-dependent FMN reductase  42.68 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  37.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  32.26 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  31.89 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  32.92 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  32.03 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  34.87 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  32.26 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.56 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  31.54 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  31.54 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  31.36 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  30.92 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  31.97 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  31.54 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  29.41 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  30.71 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  28.66 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  33.56 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  33.06 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  30.77 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  30.49 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  28.66 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  34.09 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  28.29 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  29.56 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3713  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  28.17 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  40.2 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.08 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  29.45 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  31.03 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.95 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  31.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  28.48 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  32.48 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  32.17 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  30.41 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.04 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  25.64 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  29.61 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  32.86 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>