119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1328 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  51.2 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  45.09 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  40.83 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  44.9 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  41.21 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  42.07 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  40 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  39.74 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  42.66 
 
 		 153 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  42.66 
 
 		 153 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  41.96 
 
 		 153 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0427  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2918  NADPH-dependent FMN reductase  40.76 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3775  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.436385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  38.26 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  34.62 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3713  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2472  flavoprotein  38.6 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  34.81 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  35.54 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  34.85 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  31.06 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  31.06 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  32.35 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  29.1 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  27.47 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.84 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  38.57 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  33.82 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.54 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.06 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.1 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.04 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  36.46 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  28.72 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  30.56 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  30.5 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.34 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  32.62 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  31.65 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  34.46 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  33.09 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  30.59 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  32.37 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  32.35 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  29.33 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  27.66 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  28.97 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>