181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0251 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  92.89 
 
 		 197 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  96.45 
 
 		 197 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  76.65 
 
 		 197 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  71.57 
 
 		 197 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  71.07 
 
 		 197 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  67.01 
 
 		 197 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  66.67 
 
 		 193 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  67.23 
 
 		 193 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.07 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  62.71 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  65.62 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.69 
 
 		 184 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.14 
 
 		 184 aa  205  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  61.02 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  61.58 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  57.67 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  44.69 
 
 		 188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  45.23 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  46.29 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  47.22 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  44.24 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  46.99 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  51.37 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  44.02 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  39.2 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  45.14 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  45.77 
 
 		 407 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  38.92 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  31.68 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  37.61 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  45.24 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  44.3 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  41.76 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  34.93 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  40 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  34.93 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  38.38 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  41.77 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  38.1 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  35.71 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  37.37 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  35.78 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  35.78 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  43.75 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  33.33 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  40.51 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  38 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  38.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  34.55 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  41.25 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  37.93 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  45.95 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  42.86 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  32.41 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  36.51 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  46.03 
 
 		 481 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>