256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1783 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  49.44 
 
 
198 aa  164  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  42.95 
 
 
186 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  34.88 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  34.69 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  34.88 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  40.13 
 
 
194 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  42.14 
 
 
202 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  37.07 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  33.87 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  36.94 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  38.6 
 
 
176 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  36.76 
 
 
186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  36.76 
 
 
186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
185 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  52.53 
 
 
187 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  40.79 
 
 
192 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  39.22 
 
 
186 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  33.15 
 
 
186 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  38 
 
 
189 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  35.26 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  35.26 
 
 
186 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  37.42 
 
 
191 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  38.06 
 
 
193 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
195 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
188 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
188 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  48.96 
 
 
186 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
189 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
194 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  37.27 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
189 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  35.98 
 
 
187 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  36.71 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  47 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  35.48 
 
 
186 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  37.42 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  48.89 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  45.92 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  34.36 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  36.09 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  37.42 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  32.6 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  34.23 
 
 
187 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  36.73 
 
 
186 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
430 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  40.71 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  36 
 
 
200 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  35.64 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4850  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 
196 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00494232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  35.85 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
181 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  32 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  40 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  34.29 
 
 
181 aa  82  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  36.77 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  33.97 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  37.4 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  31.61 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  42.68 
 
 
481 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  40.96 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  32.47 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  37.36 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
407 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  36.04 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>