137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2005 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
218 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  52.97 
 
 
206 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  56.74 
 
 
211 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  55.43 
 
 
206 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  57.87 
 
 
205 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  58.24 
 
 
430 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  56.74 
 
 
200 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  55.09 
 
 
199 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  55.68 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  49.09 
 
 
219 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  49.14 
 
 
208 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  48 
 
 
228 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  54.34 
 
 
252 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  51.59 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  58.17 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  51.15 
 
 
210 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  49.16 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  44.14 
 
 
224 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  55.23 
 
 
197 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
208 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  53.33 
 
 
481 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  43.35 
 
 
206 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
224 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  38.46 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  40.94 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  39.87 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  39.64 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  39.87 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  38.55 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  38.46 
 
 
191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  38.76 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  39.24 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  37.95 
 
 
186 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  40.24 
 
 
197 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  37.95 
 
 
186 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
194 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  39.74 
 
 
194 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  37.18 
 
 
186 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
185 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  37.18 
 
 
186 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
193 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
221 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 
190 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
190 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  39.05 
 
 
193 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  37.66 
 
 
193 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  39.33 
 
 
187 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  37.58 
 
 
189 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
189 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
189 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  38.64 
 
 
187 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
193 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  46.6 
 
 
187 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
185 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  44.76 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  35.29 
 
 
186 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  48.15 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  46.59 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  40 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  30.11 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
176 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  34.93 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  29.03 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
177 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  34.84 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.59 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  35.14 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.87 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  31.86 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>